データサイエンス環境構築[windows]

irm https://claude.ai/install.ps1 | iex

claude --version

claude

curl -fsSL https://claude.ai/install.sh | bash

source ~/.bashrc

claude --version

claude

claude "このガイドを読んで、〇〇の部分がわからないので教えて" -f このファイルのパス

> @ファイルパス を読んで、〇〇について教えて

wsl --install

shutdown /r /t 0

Enter new UNIX username: （好きなユーザー名を入力）
New password: （パスワードを入力、画面には表示されません）
Retype new password: （同じパスワードを再入力）

# Ubuntuのバージョン確認
cat /etc/os-release

NAME="Ubuntu"
VERSION="22.04.3 LTS (Jammy Jellyfish)"
...

sudo apt update && sudo apt upgrade -y

# 必要なパッケージをインストール
sudo apt install -y ca-certificates curl gnupg

curl -fsSL https://get.docker.com | sh

# dockerグループに自分を追加
sudo usermod -aG docker $USER

# WSLを終了
exit

wsl --shutdown

sudo service docker start

echo 'sudo service docker start' >> ~/.bashrc

docker --version

Docker version 24.0.7, build afdd53b

docker run hello-world

docker pull ghcr.io/astral-sh/uv:python3.11-bookworm

# ホームディレクトリに作業用フォルダを作成
mkdir -p ~/research

docker run -itd \
  --shm-size=8g \
  -p 8888:8888 \
  -v ~/research:/workspace \
  --name research \
  ghcr.io/astral-sh/uv:python3.11-bookworm \
  bash

docker exec -it research bash

# コンテナの一覧表示
docker ps -a

# コンテナを停止
docker stop research

# コンテナを再開
docker start research

# コンテナを削除
docker rm research

# コンテナから抜ける（コンテナは動き続ける）
exit

git --version

sudo apt install -y git

# ユーザー名を設定（GitHubのユーザー名を推奨）
git config --global user.name "あなたのGitHubユーザー名"

# メールアドレスを設定（GitHubに登録したメールアドレス）
git config --global user.email "your.email@example.com"

# デフォルトブランチ名を設定
git config --global init.defaultBranch main

# 設定を確認
git config --list

# SSH鍵を生成
ssh-keygen -t ed25519 -C "your.email@example.com"

Enter file in which to save the key: （そのままEnter）
Enter passphrase: （そのままEnter）
Enter same passphrase again: （そのままEnter）

# 公開鍵を表示
cat ~/.ssh/id_ed25519.pub

ssh-ed25519 AAAAC3NzaC1lZDI1NTE5AAAAI... your.email@example.com

ssh -T git@github.com

Are you sure you want to continue connecting (yes/no/[fingerprint])? yes

Hi username! You've successfully authenticated, but GitHub does not provide shell access.

# リポジトリをクローン
git clone git@github.com:ユーザー名/リポジトリ名.git

# 変更状態を確認
git status

# 変更をステージング（特定のファイル）
git add ファイル名

# コミット（変更を記録）
git commit -m "変更内容の説明"

# リモートにプッシュ
git push origin main

# ブランチを作成して移動
git checkout -b 新しいブランチ名

# 最新の変更を取得
git pull

[作業ディレクトリ] → git add → [ステージング] → git commit → [ローカルリポジトリ] → git push → [GitHub]

curl -LsSf https://astral.sh/uv/install.sh | sh

source ~/.bashrc

uv --version

# プロジェクトディレクトリに移動
cd /workspace

# 仮想環境を作成
uv venv

source .venv/bin/activate

# 単一パッケージをインストール
uv add numpy

# 複数パッケージをインストール
uv add pandas scikit-learn matplotlib

# 開発用パッケージをインストール
uv add --dev pytest black ruff

uv sync

# 仮想環境を無効化
deactivate

# インストール済みパッケージを確認
uv pip list

# パッケージを削除
uv remove パッケージ名

# Pythonのバージョンを指定して仮想環境を作成
uv venv --python 3.11

# 作業ディレクトリに移動
cd ~/research

# テンプレートZIPをコピー（Windowsからアクセス）
# ※ パスは自分の環境に合わせて変更してください
cp /mnt/c/Users/あなたのユーザー名/... ./miz-template-main.zip

# 展開
unzip miz-template-main.zip

# フォルダ名を変更
mv miz-template-main my-first-project

# プロジェクトに移動
cd my-first-project

# Gitリポジトリとして初期化
git init

# 全ファイルをステージング
git add .

# 最初のコミット
git commit -m "Initial commit: プロジェクトテンプレートを追加"

# リモートリポジトリを追加（URLは自分のものに変更）
git remote add origin git@github.com:あなたのユーザー名/my-first-project.git

# mainブランチとしてpush
git push -u origin main

# 展開
unzip tex_template-main.zip
mv tex_template-main my-paper
cd my-paper

# Gitリポジトリを初期化してpush
git init
git add .
git commit -m "Initial commit: LaTeXテンプレートを追加"
git remote add origin git@github.com:あなたのユーザー名/my-paper.git
git push -u origin main

my-first-project/
├── .claude/           # Claude Code用ルール
│   └── rules/
├── CLAUDE.md          # プロジェクト設定（Claudeが読む）
├── data/
│   ├── raw/           # 生データ（編集禁止）
│   ├── interim/       # 中間データ
│   ├── processed/     # 処理済みデータ
│   └── result/        # 結果
├── models/            # 学習済みモデル
├── module/            # 自作モジュール
├── notebooks/         # Jupyter Notebook
├── outputs/           # 出力ファイル
├── reference/         # 参考資料
├── scripts/           # 実行スクリプト
└── pyproject.toml     # 依存関係（uv用）

# dockerグループに追加されているか確認
groups

# 追加されていない場合
sudo usermod -aG docker $USER

# WSLを再起動
exit
# PowerShellで: wsl --shutdown

# Dockerサービスが起動しているか確認
sudo service docker status

# 起動していない場合
sudo service docker start

[wsl2]
memory=8GB
swap=4GB

wsl --shutdown

# SSH鍵のパーミッションを確認
chmod 600 ~/.ssh/id_ed25519
chmod 644 ~/.ssh/id_ed25519.pub

# 仮想環境を有効化してから
source .venv/bin/activate

# marimoをインストール
uv add marimo

# 新しいノートブックを作成
marimo edit notebooks/my_analysis.py

import marimo

__generated_with = "0.18.4"
app = marimo.App(width="medium")


@app.cell
def _():
    import marimo as mo
    return (mo,)


@app.cell
def _():
    import pandas as pd
    import numpy as np
    return (pd, np)


@app.cell
def _(mo):
    mo.md("""
    # My Data Analysis

    CSVファイルを読み込んで可視化します。
    """)
    return


@app.cell
def _(pd):
    # CSVファイルのパスを自分のものに変更してください
    DATA_PATH = "/workspace/data/raw/your_data.csv"

    df = pd.read_csv(DATA_PATH)
    df
    return (df,)


@app.cell
def _(df):
    # データの基本情報
    df.info()
    return


@app.cell
def _(df):
    # 統計情報
    df.describe()
    return


if __name__ == "__main__":
    app.run()

# プロジェクトディレクトリでClaude Codeを起動
claude

> @notebooks/my_analysis.py を見て、次にどんな分析をすべきか提案して

> このデータから異常値を検出するコードを追加して

> グラフをもっと見やすくして、論文に使えるようにして

# 既存のノートブックを開く
marimo edit notebooks/my_analysis.py

# ノートブックを実行（表示のみ）
marimo run notebooks/my_analysis.py

# Jupyter形式に変換
marimo convert notebooks/my_analysis.py -o notebooks/my_analysis.ipynb

# ブラウザで開かずVSCodeのみで使う場合
# → VSCodeでファイルを開いて拡張機能から起動